La lotta di liberazione a Tanganica fu guidata dall'Unione Nazionale Africana di Tanganica, la cui bandiera era un tricolore orizzontale di verde-nero-verde. Le elezioni confermarono il travolgente sostegno popolare all'organizzazione e le autorità britanniche suggerirono di modificare la bandiera del partito per usarla come bandiera nazionale in seguito all'indipendenza del 9 dicembre 1961. A quel tempo furono aggiunte fimbriazioni gialle.
Sotto il dominio arabo Zanzibar aveva a lungo sventolato una bandiera rossa, ma un regime dell'Africa nera salì al potere il 12 gennaio 1964, sotto una bandiera di nero, giallo e blu. Il mese seguente il partito afro-shirazi al potere introdusse una nuova bandiera nazionale simile alla sua. Le strisce orizzontali blu-nere-verdi rappresentavano rispettivamente il mare, la gente e la terra, mentre una stretta striscia verticale bianca sul paranco era per la pace.
Nell'aprile del 1964 i paesi di Tanganica e Zanzibar si unirono e, all'inizio di luglio, le loro tradizioni di bandiera furono unite per creare la nuova bandiera nazionale della Tanzania. I colori della bandiera sono stati incorporati in diagonale per il carattere distintivo. La maggior parte della popolazione del paese è simboleggiata dalla striscia nera, mentre il verde suggerisce le ricche risorse agricole della terra. La ricchezza minerale si riflette negli stretti bordi gialli, mentre l'Oceano Indiano è simboleggiato dal blu. Dopo che Zanzibar si unì a Tanganica, la bandiera di Zanzibar continuò comunque ad essere usata localmente su quelle isole.
