John Knowles Paine, (nato il 9 gennaio 1839, Portland, Maine, Stati Uniti, morì il 25 aprile 1906, Cambridge, Mass.), Compositore e organista, il primo americano a ottenere un ampio riconoscimento come compositore e primo professore di musica a un'università americana.
Dopo un'accurata preparazione musicale a Portland, Paine completò i suoi studi a Berlino (1858-1861). Nel 1861 iniziò una serie di concerti e conferenze di organi a Boston che portarono alla sua nomina nel 1862 come istruttore (in seguito professore) di musica all'Università di Harvard. Il dipartimento di musica che organizzò lì divenne un modello per quelli di molte altre università americane.
Sia come insegnante che come compositore ha avuto una grande influenza sullo sviluppo della musica negli Stati Uniti. Le sue opere, generalmente modellate sui classici tedeschi, includono due sinfonie, una messa in re (1866-1867) e l'oratorio di San Pietro (1872).
