La Moldavia ha dichiarato l'indipendenza durante la prima guerra mondiale. Nei secoli precedenti aveva fatto parte della Moldavia, della Russia, dell'Impero ottomano e della Romania, e i suoi simboli sono derivati da legami storici e culturali con la Moldavia e la Romania. La sua bandiera del dicembre 1917 era il tradizionale tricolore rumeno di blu, giallo e rosso in formato orizzontale. Al centro c'era la testa di un uro, un bue europeo estinto. Questa bandiera sventolò solo brevemente perché la Moldavia fu incorporata in Romania nell'aprile 1918. L'Unione Sovietica acquisì la Moldavia nel 1940 e, dopo l'occupazione tedesca e rumena fino al 1944, fu ristabilita la Repubblica socialista sovietica moldava. La sua bandiera distintiva, adottata nel 1952, ha aggiunto una striscia orizzontale verde attraverso il centro della bandiera rossa sovietica. Si diceva che il verde rappresentasse la viticoltura e le altre attività agricole della zona.
Nel 1989 l'agitazione contro il dominio comunista era forte in Moldavia e il tricolore rumeno blu-giallo-rosso divenne un simbolo popolare. Ha sostituito ufficialmente la bandiera comunista nel maggio 1990. Il nuovo stemma della Moldavia, basato su disegni tradizionali, è stato aggiunto il 3 novembre di quell'anno: sul petto di un'aquila è uno scudo con la testa di un'auro circondata da una mezzaluna, stella e fiore. Emblema tradizionale del territorio rumeno della Valacchia, l'aquila tiene uno scettro e un ramo d'ulivo nei suoi artigli e una croce nel becco. I colori rosso, blu e oro dello scudo riflettono il tricolore nazionale. La bandiera rimase ufficiale dopo l'indipendenza della Moldavia nel 1991.
