Comayagua, città, centro-ovest dell'Honduras, sulla riva destra del fiume Humuya in una fertile valle.
Fondata nel 1537 come Valladolid de Santa María de Comayagua, la città fu la capitale coloniale spagnola della provincia dell'Honduras. Una variante del suo nome, Comayaguela, viene utilizzata per il distretto governativo di Tegucigalpa. Subì danni negli sconvolgimenti politici del XIX secolo in Honduras e nella rivalità con Tegucigalpa per la posizione di capitale nazionale, ma solo nel 1880 la capitale fu infine trasferita a Tegucigalpa. La città ha anche subito danni a causa di numerosi terremoti e incendi ripetuti.
Gli edifici coloniali includono una notevole cattedrale barocca spagnola (1715), quattro chiese del XVI secolo e un'antica università, la prima in America centrale, fondata nel 1632. Comayagua produce prodotti farmaceutici, scarpe, resine, prodotti in cemento e ceramica; è il centro commerciale per l'Honduras occidentale. Il centro agricolo nazionale si trova in città. Gran parte del centro, tra cui la cattedrale e il parco centrale, è stato rinnovato per ripristinare l'atmosfera coloniale della città e il suo fascino unico.
L'autostrada inter-oceanica attraversa la città. Comayagua ha anche un campo d'aviazione, che è stato aggiornato nei primi anni '80 in una base aerea militare. Appena fuori Comayagua si trova Palmerola, la principale base militare americana in Honduras, che è condivisa con le forze aeree dell'Honduras. Pop. (2001) 55.368; (2013) 92.883.
