Michael Haydn, in pieno Johann Michael Haydn, (battezzato il 14 settembre 1737, Rohrau, Austria — morì il 10 agosto 1806, Salisburgo), uno dei più autorevoli compositori di musica sacra alla fine del XVIII secolo. Era il fratello minore di Joseph Haydn.
Come suo fratello, Michael Haydn divenne coro nella Cattedrale di Santo Stefano a Vienna, ricevendo le sue prime lezioni musicali lì. Fu licenziato dalla scuola del coro quando la sua voce si spezzò, e poi si guadagnò una vita precaria come musicista freelance. Nel 1757 divenne capostipite del vescovo di Grosswardein in Ungheria (ora Oradea, Rom.), E nel 1762 divenne primo violino dell'arcivescovo di Salisburgo. Rimase a Salisburgo come primo violino per il resto della sua vita e successe a Wolfgang Amadeus Mozart come organista della cattedrale nel 1781.
Durante la sua vita Michael Haydn era considerato un compositore di musica sacra migliore di suo fratello. Delle molte messe che scrisse, Missa a due cori (conosciuta anche come Missa Hispanica; 1786) è un'opera eccezionale per orchestra e solisti vocali, e il suo Requiem del 1771 influenzò il famoso Requiem di Mozart del 1791. Haydn scrisse anche numerose sinfonie, divertimenti e altre composizioni secolari. Era un intimo amico di Mozart (che scrisse i suoi duetti violino-viola per adempiere a una commissione che Haydn era troppo malato per completare) ed era un insegnante di Carl Maria von Weber. Dopo la sua morte, la reputazione di Haydn subì una lunga eclissi, e fu solo dopo la seconda guerra mondiale che il suo merito fu nuovamente riconosciuto.
